新疆生產建設兵團承擔著國家賦予的屯墾戍邊職責，實行黨政軍企高度統一的特殊管理體制，在所轄墾區內，依照法律、法規自行管理內部行政、司法事務，是在國家實行計劃單列的特殊社會組織，受中央政府和新疆維吾爾自治區雙重領導；所屬師、團場及企事業單位分布于新疆維吾爾自治區各行政區內，主要由兵團自上而下地實行統一領導和垂直管理。

新疆生產建設兵團各級都建有中國共產黨的組織，發揮著對兵團各項事業的領導作用。兵團設有行政機關和政法機關，自行管理內部行政、司法事務。兵團是一個“準軍事實體”，設有軍事機關和武裝機構，沿用兵團、師、團、連等軍隊建制和司令員、師長、團長、連長等軍隊職務稱謂，涵養著一支以民兵為主的武裝力量。兵團也稱為“中國新建集團公司”，是集農業、工業、交通、建筑、商業，承擔經濟建設任務的國有大型企業。兵團的黨、政、軍、企四套領導機構與四項職能合為一體，在戰略地位重要、團場集中連片、經濟基礎好、發展潛力大的墾區，設有若干個“師市合一”的新疆維吾爾自治區直轄縣級市和若干個“團（場）鎮合一”的建制鎮，由兵團實行統一分級管理，“師和市”、“團（場）和鎮”黨政機構設置均實行“一個機構、兩塊牌子”。

2021年，新疆生產建設兵團實現生產總值3395.61億元，比上年增長8.0%。